Après avoir combattu le Vampire de Prague, Hellboy est mort et erre en Enfer. Il est touché par une maladie fatale, et trouve l'aide d'une équipe de docteurs totalement incompétents. Alors qu'il explore cet étrange territoire, nouveau pour lui, sa route croise celle de l'Arbre-Monde qu'il a aidé à créer, mais aussi sa propre soeur qui l'accuse d'un terrible crime…
