Suite à un accident grave, l'adolescent frustré Eishi et ses trois amis passent un pacte avec un mystérieux garçon ailé. Ils voient alors des ailes pousser dans leur dos et se trouvent dotés d'étranges pouvoirs. Ainsi, les quatre collégiens apprennent à voler, et à combattre des monstres mystérieux du nom de Black-out qui apparaissent sans crier gare. Un jour, après une dispute avec sa mère, Karasuma seul tombe sur un des monstres et parvient à le vaincre tant bien que mal...
Quels seront les prochaines épreuves ? Alors qu'à Tokyo, nos cinq amis décident de former le club des Birdmen, la nature de ceux-ci se dévoilent peu à peu. Comme Takayama, chaque Birdman peut donner naissance à d'autres Birdmen. Ainsi, à partir d'un Birdman d'origine, ils se multiplient potentiellement à l'infini. Or il apparaît que les Birdmen fonctionnent en réseau, à même de déclencher leur transformation par simple toucher entre eux, capables également de sentir la présence de congénères par télépathie.
De plus, nos héros japonais découvrent qu'ils sont individuellement plus puissants contre les Black-out s'ils sont ensembles. Pendant ce temps, une mystérieuse organisation d'humains suit cette évolution avec grande attention, d'autant que les Birdmen semble se multiplier bien en dehors du Japon, alors qu'ils sont à la recherche de l'individu d'origine, le "patient zéro", la première des Birdmen, nommée Eva.
