Au cours d'une sortie, les Tortues Ninja perdent la toute dernière invention de Donatello. Manque de chance, celle-ci tombe entre de mauvaises mains, et un nouveau méchant fait son apparition à New York. Pour protéger la ville et réparer leur erreur, les Tortues vont devoir appliquer les préceptes ninjas que leur a appris Maître Splinter !
