Pierre-Marie Hamon, étudiant en thèse d'anthropologie, est envoyé au coeur du Sahara libyen pour y analyser le comportement des derniers Garamantes, une puissante peuplade déchue. Au terme d'un voyage dont le confort se limite à ce que lui permet sa bourse d'études, Pierre-Marie atteint les lieux de son étude, découvrant une oasis déserte dépourvue de toutes traces de civilisation. Témoin inattendu d'une cérémonie macabre à la tombée de la nuit, il se lance à corps perdu à la recherche de ces fantômes qui disparaissent sans laisser de trace.
De déconvenues en découvertes et de déserts en métropoles, Pierre-Marie remontera la piste des Garamantes, aux sources d'une vérité surprenante. Axé autour de dates formelles, de faits avérés et d'anecdotes véridiques, le Secret des Garamantes offre une version troublante et mystérieuse qui prolonge, le temps d'un roman, des existences hors du commun.