Joseph Gonthier a exercé auprès des préfets des départements de l'Oise puis des Yvelines, un rôle de collaborateur pour les affaires de sécurité et de défense civiles. Il était chargé de réaliser les plans d'intervention des pouvoirs publics en cas d'accident naturel ou technologique majeur, d'entraîner les divers organismes à leur mise en oeuvre puis coordonner l'action de ces derniers en cas d'événement réel. C'est ainsi notamment qu'il a eu à gérer les graves inondations des bassins de l'Oise et de l'Aisne en 1993 et 1995 et a terminé sa carrière en coordonnant, dans les Yvelines, le dispositif de vaccination du public contre le virus de la grippe A H5N1 en 2009-2010. Sa solide expérience professionnelle l'a amené à animer de nombreuses conférences ou séances de sensibilisation-formation à la sécurité civile au profit non seulement des services de l'Etat mais également des collectivités locales, des enseignants, des industriels et du tout public. Il s'est toujours efforcé de propager la culture de gestion de crise au sein de la population et à la faire participer autant que possible à certains des quelque 90 exercices départementaux organisés tout au long de ses 25 années au poste de directeur de Service Inter-ministériel de Défense et protection Civiles.
