Stefan Fischer a étudié l histoire de l art, l histoire et l archéologie classique à Münster, Amsterdam et Bonn. En 2009, il a soutenu sa thèse de doctorat intitulée «Hieronymus Bosch: Malerei als Vision, Lehrbild und Kunstwerk» (Jérôme Bosch: La peinture comme vision, image instructive et oeuvre d art). Ses axes de recherche sont la peinture néerlandaise du XVe au XVIIe siècle et la muséologie.