Dans ce travail nous avons essayé de mettre l'accent sur les caractères morphologiques, physiologiques et le marquage moléculaire pour l'évaluation du polymorphisme phénotypique et génétique chez les espèces du genre Tamarix dans différents écotopes de les zones arides de Khenchela (Est Algérien), où ce genre représente un intérêt important dans la réhabilitation des écosystèmes dégradés. L'évaluation de la résistance à la salinité a révélé que les boutures du Tamarix résistent à une dose de 64g/l de NaCl, concernant les résultats de l'accumulation de la proline, l'analyse statistique par ANOVA à un critère contrôlé montre qu'il n'existe pas une signification entre l'effet dose et accumulation de la proline. Par contre la quantité et la qualité des métabolites primaires et secondaires ainsi que l'effet bactéricide de ces derniers sont étroitement liés aux conditions du milieu. L'étude de polymorphisme génétique chez les espèces du genre Tamarix, en utilisant le marqueur moléculaire de type SSR a montré que les accessions étudiées sont très éloignées.