Jonathan n'a que 10 ans, mais il a de quoi être fier. Lui, si jeune, s'apprête déjà à détenir son dragonneau. Dans la famille Sato, c'est une tradition. On est chevalier dragon de père en fils et protecteur du Royaume de Sitra depuis que l'épidémie de l'equyose a quasiment décimé le monde de ces fabuleuses créatures. Depuis vingt ans, les guerres ont pris fin et la vie est désormais plus paisible dans les rues de Vyria où Jonathan, sa petite soeur Emy et son meilleur ami Jany aiment à musarder.
Mais un jour, lors d'une escapade au coeur de la Forêt des Nids, les trois enfants découvrent un souterrain oublié. Un souterrain gardant dans ses profondeurs une science sacrée qui pourrait bien bouleverser l'équilibre du monde...