Fin août 1944. Alors qu'une bonne partie de la France est libérée, à Villeneuve, petite ville imaginaire du Jura, les Allemands sont toujours là, mais plus pour longtemps. Le réseau de Résistance de Marie Germain agit maintenant sous le contrôle des Américains. Pendant que les miliciens à la solde de l'occupant continuent de tuer des civils et des résistants, le Kreiskommandant Schneider reçoit l'ordre de convoyer vers la Gestapo de Belfort un dernier convoi de Juifs. Parmi eux : Rita et son fils David. Le commissaire Jean Marchetti, désormais désigné comme "le boucher de Villeneuve", va tenter de se racheter en arrachant aux griffes des nazis la jeune femme et l'enfant qu'ils ont eu ensemble. L'imminence du départ des Allemands amène chacun à se positionner dans "l'après". Les désaccords idéologiques et politiques ressurgissent entre gaullistes et communistes. Puis la Libération amène son lot de joies - un grand bal - et de vengeances sauvages : le massacre des miliciens, la chasse aux collabos, l'humiliation publique des "femmes à Boches"... Louis Bériot, le nouveau préfet issu de la Résistance, aura bien du mal à rétablir l'ordre républicain souhaité par le général de Gaulle.
