L'Eglise a pris acte du refus de nombreuses communautés politiques d'écouter son message. Mais elle continue de défendre son autonomie, le fondement moral du politique et la coopération des deux ordres. A quoi bon, si les Etats rejettent la vocation de l'Evangile à pénétrer les réalités temporelles ? Depuis la dissolution de la chrétienté médiévale, la théologie catholique a approfondi la relation de l'Eglise et du politique en trois étapes, incarnées par saint Robert Bellarmin, Jacques Maritain et Charles Journet, Joseph Ratzinger-Benoît XVI.
Leur étude fait apparaître un unique enjeu : l'accès à la vérité de la conscience, prise entre l'obéissance à Dieu et aux hommes. C'est à la fin la liberté humaine qui est en jeu : liberté de l'acte de foi et liberté tout court. Apparaît aussi l'ancrage de la théologie du politique dans "les principes énoncés en son temps par saint Thomas" , comme le rappelle François Daguet dans sa préface.