Le ver est dans le fruit se déroule avant et durant le second conflit mondial. Le Burundi est soumis aux réquisitions de bétail opérées par la tutelle coloniale belge, qui ravive des césures antérieures au sein de la collectivité. Le roman relate la vie quotidienne de personnes ordinaires dans les collines pastorales, à l'écart des centres urbains issus de la colonisation. Ceux-ci, présents mais situés à distance du coeur de l'action, forment les espaces majeurs et symboliques de la christianisation, cet effet important de la défaite du Mwami Mwezi Gisabo et du silence supposé d'Imana.
Dans le récit, elle est rendue palpable à travers tel ou tel couple, tel ou tel comportement lié au précepte d'amour du prochain qui heurte des réflexes ancestraux et ataviques, entraînant par exemple des problèmes de conscience face aux nécessit és de la vengeance traditionnelle. Coédition avec les Archives & Musées de la Littérature