Lorsque le gouvernement japonais introduit J-ctOS, un logiciel développé par la corporation Blume Japan, le quotidien de la société change radicalement. Seulement, la population n'est pas consciente que cette technologie d'un genre nouveau risque de la priver de sa liberté... Face à ce système invasif et corrompu, un groupe de hackers de l'ombre appelé Dedsec, décide d'agir pour révéler au grand jour cette machination.
Gôda, un agent de police avide de justice, se prend alors peu à peu dans une toile morale qui le dépasse... Watch Dogs Tokyo est le tout premier manga inspiré de la populaire franchise de jeu vidéo Watch Dogs ® d'Ubisoft (Assassin's Creed®, Far Cry®, The Division®...) !