L'Académie Cross est une école bien particulière. En effet, les humains de la Day Class cohabitent avec les vampires de la Night Class. Pour maintenir l'ordre et éviter les débordements, le directeur a chargé Yûki et Zero de maintenir la discipline. Mais la jeune Yûki, qui rêve de voir les humains et les vampires vivre en paix, devra choisir entre Kaname, le sang pur qui lui a un jour sauvé la vie, et Zero, son ami d'enfance...
