En 1964, le Japon connaît de grands changements à l'approche des jeux olympiques. Suite aux séquelles d'une opération subie dans son enfance, l'adolescent Kuroo Hazama se retrouve dans un fauteuil roulant, les jambes paralysées. Yajima, l'ancienne vedette du club de baseball de son lycée a lui aussi perdu l'usage de ses membres inférieurs. Une lueur d'espoir est donnée à ces compagnons d'infortune par un médecin convaincu que la pratique du basket fauteuil peut les aider... Le jeune Black Jack forge sa personnalité de futur médecin au coeur d'une société en pleine mutation.
