Pour échapper à l'ambiance étouffante du noviciat, Thomas, jeune jésuite, écrit un roman mettant en scène Jean-Baptiste, bibliothécaire au Vatican qui découvre par hasard un manuscrit du XII siècle, intitulé Mystalogia. Mais une mystérieuse organisation cherche à s'en emparer et oblige Jean-Baptiste à entamer une fuite qui le mènera sur la trace des Templiers, de l'Angleterre à l'Afrique, où il croisera des espions, d'anciens nazis et de curieux hommes d'Eglise. Cependant, la fiction ne tarde pas à rejoindre la réalité et Thomas se voit rattrapé par son personnage. C'est ensemble qu'ils vont découvrir cet objet inaccessible qu'est le Graal. Mystalogia ne cesse de jouer sur deux quêtes parallèles l'une intérieure où s'agitent les interrogations et les certitudes, l'autre pleine d'aventures et de rebondissements qui entraînent le lecteur aux quatre coins du monde.
