Les marqueurs génétiques sont largement utilisés aujourd'hui pour estimer le polymorphisme et prédire l'évolution des populations végétales. Au cours de ces dernières années, l'avancée dans la connaissance du génome des plantes a favorisé le développement de marqueurs moléculaires ciblant une région de l'un des génomes - nucléaire, chloroplastique et mitochondrial.
Le développement de la génomique donne ainsi accès aux gènes contrôlant des caractères adaptatifs, particulièrement importants pour la gestion des ressources génétiques. Si les arbres forestiers servent ici à illustrer les questions relatives à la gestion des ressources génétiques en raison de leur importante diversité et des menaces qui pèsent sur cette dernière, cet ouvrage est d'intérêt beaucoup plus général et concerne aussi la génomique et la génétique végétales. Les principales méthodes d'analyse du génome sont décrites, ainsi que la plupart des marqueurs moléculaires et leurs caractéristiques : région du génome ciblée, hérédité, reproductibilité. En fonction des objectifs, des marqueurs sont proposés et leur utilisation discutée.
