Pendant la 2nd moitié du XXe siècle, des spécialistes de l'histoire comtoise ont réuni leur savoir pour retracer l'évolution de la province depuis la préhistoire jusqu'à l'époque contemporaine. Aujourd'hui pour couvrir l'ensemble de l'aventure humaine sur le sol de la Comté, quatre historiens se sont répartis la tâche, en fonction de leurs spécialités à travers trois volumes. Ce second tome commence au XIVe siècle sous l'autorité des Habsbourg et continue avec les ravages de la guerre de Dix ans pour finir sous l'invasion de Louis XIV.