Elève du Prytanée national militaire, Jean-Paul JACQUET entre à l'Ecole navale en 1971 avec l'arrière-pensée de choisir ensuite la spécialité de pilote d'avion. Breveté d'aéronautique en 1976, il effectue l'essentiel de sa carrière en flottille sur BR 1050 ALIZE au sein de l'aviation de sûreté embarquée. A l'issue du commandement de la flottille 6F, il est affecté dans les états-majors parisiens, avant d'occuper le poste de chef du groupement des services opérations au sein de l'aéronautique navale de LANDIVISIAU.
Il quitte l'uniforme en 1995 pour une seconde carrière dans la haute fonction publique, principalement au ministère de la Défense. Titulaire de la qualification porte-avions n° 903, il totalise 411 appontages dont 113 de nuit, tous sur BR 1050 ALIZE