Toute la philosophie de Leibniz tend essentiellement à réconcilier la raison avec la foi. Ces deux aspects de l'intelligibilité ne doivent point être dissociés sous prétexte d'objectivité ou de révélation. Ni la nature n'est dépourvue de la grâce, ni celle-ci n'est étrangère à la phénoménalité. L'univers présente deux plans distincts mais complémentaires, inexplicables l'un sans l'autre : celui des causes finales et celui des causes efficientes ; vouloir négliger les unes au profit des autres, c'est ne pas accepter les conséquences logiques de la définition de Dieu. La philosophie de Leibniz, c'est surtout la doctrine de la substance et de l'harmonie préétablie, car cet univers qui fait l'objet d'une investigation scientifique, représente une hiérarchie de substances plus ou moins complexes qui justifient, à la fois, le purement phénoménal, ou saisi comme tel, et l'exclusivement ontologique et moral.
