Jean Nallit entre très tôt dans les mouvements de Résistance à Lyon. En charge notamment de la liaison et de la mise à disposition de faux papiers, il fait réaliser de nombreuses fausses cartes d'identité permettant notamment à des résistants et à des Juifs d'échapper aux traques nazies.Arrêté en 1944 par la Gestapo, il est envoyé dans l'enfer de Buchenwald. Après de long mois en camp de concentration, il participe aux "marches de la mort".
Il est libéré en 1945 par l'armée américaine.