Prêtre à Besançon depuis 1963, Jean Cachot a commencé dans l'aumônerie de l'enseignement public, et depuis plus de 35 ans, il fréquente presque quotidiennement la détention de la maison d'arrêt de Besançon. Ce faisant, il a été responsable de l'aumônerie de la région pénitentiaire de Dijon, et de la formation de ses collègues pour l'aumônerie nationale et européenne. Parallèlement, le Secours catholique national lui a demandé de donner la main à la formation de ses intervenants dans le monde carcéral.
En 2001, avec Hervé Renaudin, alors théologien de l'aumônerie et Jean-Hubert Vigneau, aumônier général, il a réalisé La peine et le pardon, publié aux Éditions de l'Atelier, où ils ont donné la parole à près de sept-cents prisonniers.