En 2078, après un cataclysme mondial, une nouvelle espèce, les chimères, hybride entre l'homme et l'animal, apparaît. Devant ce phénomène de masse, la société humaine adopte une politique d'exclusion et de persécution, les obligeant à vivre dans la peur. Homura est un jeune adolescent solitaire et rejeté par ses camarades. Le jour de son anniversaire, sa vie bascule. Sans y être préparé, il va plonger au coeur de la bataille opposant les Anticorps, souhaitant la disparition des chimères, aux Chevaliers noirs qui, eux, veulent la protéger.
