Au sein de l'Opéra Garnier, des événements mystérieux et effrayants se produisent. Un machiniste est retrouvé pendu et on parle d'un fantôme machiavélique au visage masqué qui hanterait le théâtre et occuperait la loge numéro 5 pendant les représentations... Christine Daaé est une jeune chanteuse de plus en plus admirée. Le vicomte Raoul de Chagny est secrètement amoureux d'elle. Il ignore encore qu'elle est la protégée bien involontaire du fameux fantôme...
Le piège se resserre sur la pauvre Christine... qui va disparaître. 20 ans après les événements, Rouletabille rouvre l'enquête pour résoudre enfin l'énigme du Fantôme de l'Opéra.
