Depuis le Moyen-Age, la royauté et l'inquisition veulent mettre la main sur le secret de Nicolas Flamel, l'alchimiste qui a découvert la pierre philosophale, capable selon la légende de transmuter le plomb en or et de révéler la clé de toute chose. De nos jours, le commissaire Antoine Marcas assiste à un double meurtre sauvage dans le plus grand temple maçonnique français. Le tueur ? Un franc-maçon qui se proclame le "frère de sang". Une course contre la montre est déclenchée entre le policier et l'énigmatique assassin pour retrouver le secret de Flamel.