Cinq essais sont consacrés à la science de la nature et abordent diverses questions scientifiques. Avec Ethique et politique (1995) et Esthétique et métaphysique (1999), Philosophie et science de la nature compose d'ailleurs un véritable triptyque, permettant de couvrir tout le champ de la métaphysique, que Schopenhauer distribue selon trois objets : la nature, le beau et les moeurs. De fait, la lecture de ces essais, intitulés "Philosophie et science de la nature", "Sur la philosophie et sa méthode", "Logique et dialectique", "Sur la théorie des couleurs", et enfin "De la physiognomie", permet de retrouver les thèmes métaphysiques essentiels de Schopenhauer. Par bien des aspects, la réflexion de Schopenhauer se révèle d'une grande profondeur théorique, notamment dans l'analyse anti-kantienne de l'ancrage empirique de toute science et métaphysique, et dans l'affirmation du caractère non apodictique des sciences autres que logique et les mathématiques. Sur un point particulier, enfin, celui de la théorie des couleurs, sa réflexion se révèle incontournable, prolongeant, tout en la modifiant quelque peu, l'approche physiologique de Goethe.
