Thomas d'Aquin commente et enseigne le texte biblique de la même manière que les textes profanes. Pourtant la lecture biblique joue chez l'Aquinate un rôle particulier dans la doctrine sacrée considérée comme science : par cette lecture, le commentateur acquiert une participation à la sagesse de Dieu qui permet au théologien de forger les principes dont il a besoin pour argumenter scientifiquement puisque le commentaire est considéré comme un prolongement homogène du texte inspiré. Le Commentaire de l'évangile de Jean est un bon témoin de cela dans l'oeuvre du dominicain. La Samaritaine y est présentée comme le modèle du chemin intellectuel que le lecteur biblique doit parcourir : elle écoute le Christ puis l'annonce, conduisant ainsi les habitants à venir au Christ. Elle écoute les mots humains de Dieu et cherche à les pénétrer, elle peut alors prendre à son tour la parole et conduire ses auditeurs à la source de la sagesse.
