La Philosophie zoologique (1809) de Lamarck (1744-1829) compte parmi les classiques de l'histoire des sciences. C'est l'acte de naissance du transformisme ; le temps fait son entrée dans l'étude des êtres vivants, et tout d'abord dans leur classification qui doit être généalogique : des êtres les plus simples, apparus par génération spontanée, dérivent des êtres de plus en plus complexes jusqu'à, et y compris, l'homme.Mais la Philosophie zoologique est aussi et plus encore qu'un exposé du transformisme, le texte fondateur de la biologie. Non seulement Lamarck invente ce terme de biologie pour désigner la science des êtres vivants, mais il définit celle-ci comme science autonome, affirmant la radicale différence entre vivants et objets inanimés en même temps que l'identité des lois physiques régissant les uns et les autres : les êtres vivants ont simplement une organisation particulière telle que le jeu de ces lois entraîne la vie en place de l'inertie.Texte foisonnant enfin, la Philosophie zoologique s'achève sur une extension du transformisme à la psychologie et l'exposé d'un modèle ou les différentes opérations de la pensée sont ramenées à des mouvements de "fluides nerveux"...