592 - 645 : Grandeur et décadence de la lignée des Soga, maîtres féroces et incontestés de l'empire du Japon, qui imposent le bouddhisme au pays. Entre dévotion et intrigues, nul n'échappe à leur contrôle et à leur cruauté. On les croit invincibles, jusqu'à la chute soudaine, imprévisible, causée par les yeux d'une belle. 1892 - 1945 : A l'autre bout de l'échelle temporelle, on découvre le dernier descendant des Soga. Fils d'un ferblantier et d'une nymphomane, Hitoshi est ennuyeux, froid, mais terriblement intelligent. Devenu professeur de logique à l'université impériale, engagé dans les services secrets, il se lie avec deux militaires nationalistes qui acceptent de financer le projet de sa vie : une machine à coder. Il en profite pour détourner des fonds et construire un temple bouddhiste à la mémoire de ses illustres ancêtres. Au plus fort de la guerre, sa réussite est exemplaire mais son déclin est imminent... Mikrokosmos est un conte parodique où s'entrechoquent les absurdités de l'Histoire et le futur révèle le passé...